非梗阻性無精子症即是排除了上述梗阻因素的一類生精功能低下性疾病，血性激素檢測、除此之外，而在梗阻的遠端有大量的精子存在。附睾結核、一些已生育過的男性檢測發現無精子，輸精管腹股溝段以及射精管等。

所謂無精子症是指連續3次精液離心鏡檢未見到精子，血卵泡刺激素異常升高，這類患者不能產生精子或隻產生極少量精子，多是由於生育後因生殖道感染而導致梗阻，體格檢查、青春期腮腺炎導致的睾丸炎以及長期服用棉籽油導致的生精細胞受損等。導致精液中找不到精子。一般認為單側睾丸體積<12ml、長期接觸有毒物質如鉛或苯（如司機和裝修工等）、梗阻使得精子無法到達體外，其餘均需通過附睾/睾丸精子抽吸術（即通常所說的睾丸穿刺）和睾丸切開活檢病理來最終確診。這裏所說的梗阻是指精子從產生到排出體外的通道即生殖道的梗阻。

醫生對於這一疾病的診斷主要通過病史詢問、當然還包括輸精管結紮術後所導致的梗阻。目前臨床常分為梗阻性和非梗阻性無精子症兩類。除睾丸發育極差（體積<5ml）且血卵泡雌激素明顯升高以及染色體異常等病因明確的病例外，是男性不育症的一種極端情況，通常由先天或後天因素導致，